Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Impg1Q8R1W8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Impg1Q8R1W8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms