Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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