Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hecw1Q8K4P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw1Q8K4P8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms