Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ltbp4Q8K4G1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltbp4Q8K4G1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms