Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
OptnQ8K3K8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OptnQ8K3K8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms