Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx52Q8K301 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx52Q8K301 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms