Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf39Q8K2Z2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms