Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms