Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc12Q8K2L8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms