Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scara5Q8K299 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scara5Q8K299 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scara5Q8K299 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scara5Q8K299 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Scara5Q8K299 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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