Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnpt1Q8K1R3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms