Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn34c1Q8K193 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Cldn34c1Q8K193 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms