Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FgbQ8K0E8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms