Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkn3Q8K045 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms