Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip10Q8CJ53 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms