Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms