Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SbsnQ8CIT9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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