Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trpm6Q8CIR4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trpm6Q8CIR4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpm6Q8CIR4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpm6Q8CIR4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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