Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mterf1aQ8CHZ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms