Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tshz3Q8CGV9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms