Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rab43Q8CG50 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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