Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd1bQ8CFT2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd1bQ8CFT2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms