Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms