Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lancl3Q8CD19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lancl3Q8CD19 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms