Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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