Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms