Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nrip1Q8CBD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nrip1Q8CBD1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms