Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Fbxo48Q8CAT8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fbxo48Q8CAT8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms