Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms