Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms