Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg16l1Q8C0J2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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