Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms