Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbbp5Q8BX09 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms