Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl3Q8BVF2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms