Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gga3Q8BMI3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gga3Q8BMI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms