Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp54Q8BL06 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp54Q8BL06 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms