Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan12Q8BKT6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan12Q8BKT6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms