Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp1Q8BJQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp1Q8BJQ2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp1Q8BJQ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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