Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox2Q8BII1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms