Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdca8Q8BHX3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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