Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smndc1Q8BGT7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smndc1Q8BGT7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms