Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Best2Q8BGM5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Best2Q8BGM5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms