Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8BGC1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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