Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trmt12Q8BG71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms