Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.4Q85ZW8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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