Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc50Q810U5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc50Q810U5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms