Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kdm5bQ80Y84 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kdm5bQ80Y84 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms