Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk9Q80W65 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pcsk9Q80W65 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms