Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma8aQ80VM8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma8aQ80VM8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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