Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc155Q80VJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc155Q80VJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms